PDFにはCMYKとRGBの2つのカラーモードが存在します。
このカラーモードの違いにより、デバイスによっては見え方が異なったりします。
Javaでサムネイル作ったと思ったら満足な色で出力されなかったり、とか。
このカラーモードを変換したい場合、基本的には有料のAdobe Acrobatが必要ですが、RGBへの変換であればWindows10のPC上で可能です。
手順(Windows10が必要)
PDFファイルを開く
印刷を選択し、プリンタの一覧から「Microsoft Print to PDF」を選択
印刷を実行するとファイル保存ダイアログが表示されるので、任意の場所に保存
これで、RGBプロファイルのPDFが出力できます。